Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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