Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NelfeP19426 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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