Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms