Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18533 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18533 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18533 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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