Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms