Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcl1P12850 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms