Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DmdP11531 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DmdP11531 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DmdP11531 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms