Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P10404 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P10404 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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