Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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