Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms