Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms