Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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