Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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BckdkO55028 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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BckdkO55028 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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BckdkO55028 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BckdkO55028 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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