Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjd2O54851 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd2O54851 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd2O54851 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd2O54851 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjd2O54851 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms