Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PnnO35691 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PnnO35691 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PnnO35691 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PnnO35691 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms