Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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