Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clk2O35491 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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