Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f3O35261 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms