Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptpn9O35239 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms