Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms