Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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