Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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