Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms