Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm20830J3KML6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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