Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r58G3X9U3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms