Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms