Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zc3h7bF8VPP8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms