Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd50F7BE84 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd50F7BE84 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms