Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm3250E9Q1M3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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