Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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