Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc1E9Q043 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms