Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifit3bE9PV48 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms