Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms