Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpb1B2RS76 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpb1B2RS76 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms