Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms