Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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