Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palm3A2TJV2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms