Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms