Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms