Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms