Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb2Q9R1P3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms