Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gpc6Q9R087 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gpc6Q9R087 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gpc6Q9R087 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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