Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms