Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Six6Q9QZ28 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Six6Q9QZ28 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Six6Q9QZ28 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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