Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms