Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pole3Q9JKP7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pole3Q9JKP7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pole3Q9JKP7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pole3Q9JKP7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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