Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ybx3Q9JKB3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms