Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms