Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms