Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim39Q9ESN2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim39Q9ESN2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim39Q9ESN2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim39Q9ESN2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim39Q9ESN2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Trim39Q9ESN2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trim39Q9ESN2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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